エンジェル島から日本に戻ってきたノアだが、何者かに連れ去られ、再び祈祷師のピューマに捕まってしまう。いっぽうのルーナにも、謎の科学者・笹林の魔の手が迫る。難をのがれた2人は、久しぶりの再会をはたすが…。