黒船襲来の12年前。土佐の漁師の息子・万次郎は初めての漁に出て嵐に遭い、無人島に漂着する。米捕鯨船ジョン・ハウランド号に救助され、乗組員としてすごしながら、長い航海を経て新天地に降り立つが…。